Az évad második felében két Atlantiszos főszereplő az SG:U sorozatban is szerepelni fog. SPOILER következik!
A két karakter Dr. Rodney McKay (David Hewlett) és Richard Woolsey (Robert Picardo) a Seizure című epizódban fognak szerepelni. Egyelőre nem derült ki, hogy hogyan kapcsolódnak a hajó es legénysége sorsához, de várhatóan Rodney segítségére lesz szükség az Ős rendszerek kijavítására, míg Woolsey valószínűleg az IOA miatt Wray karakterével lesz összefüggésben.
Korábban a készítők elzárkóztak a cross-overtől, hogy a két testvérsorozat cselekménye ne keveredjen. Még mindig él ugyanis a remény az SG:A - Extinction című DVD film leforgatására, de az MGM anyagi helyzete miatt ez már lehet, hogy soha nem készül el. Úgyhogy most a producerek úgy döntöttek, hogy nem várnak tovább a stúdióra és inkább majd a film forgatókönyvét igazítják az SG:U sorozathoz.