A készítők ígérete szerint legalább két meleg karakter lesz a sorozatban, de egyelőre még nincs hír arról, hogy ez egy párt jelentene-e. A "Life" című részből félig-meddig kiszivárgott spoilerek alapján az egyik illető a Ming-Na által megformált Camille Wray lesz, aki a kedvesét, Sharont hagyta hátra a Földön. A részben az Ős kommunkációs berendezés segítségével megpróbál majd kapcsolatban lépni vele.

Az sorozat producerei nem a nézettség miatt mesélnek be meleg karaktereket, hanem a társadalmunkat próbálják modellezni. Korábban az egyik Atlantisz 5. évadban szereplő katonanőről (Alicia Vega) derült ki JM blogja alapján, hogy a nőkhöz, egész pontosan Dr. Kellerhez vonzódik, ám mivel az erre utaló jeleneteket törölték és a karakter is a tervezetthez képest másképpen fejezte be a pályafutását, így ez már csak utólag adott információ volt. JM szerint egy másik Atlantiszos karakterről is kiderült volna, hogy homoszexuális, de végül ezt a kártyát sem játszották ki az utolsó részekben.