A GateWorld rajongói oldal nyilvánosságra hozta az első 8 epizód rövid leírását is. SPOILER következik!

4x01 Adrift
A Pegazus-replikátorok pusztító támadása után Atlantisz ismeretlen űrben reked 24 órányi levegővel, így az expedíciónak valahogy meg kell javítania a város hiperhajtóművét. Dr. Weir életét egy súlyos sérülés fenyegeti.

4x02 Lifeline
Sheppard alezredes és csapata egy ZPM-et kell szerezni a Replikátoroktól, hogy életben tarthassák Atlantiszt, miközben Sam Carter ezredes és az Apollo hajó az idővel versenyezve kutatnak a város után.

4x03 Reunion
Rononnak el kell döntenie, hogy kik a barátai, mikor találkozik anyabolygójának túlélőivel, akik rá akarják venni, hogy csatlakozzon hozzájuk és hagyja ott a földi expedíciót.

4x04 Doppelganger
Egy idegen világon Sheppard alezredes csapata belebotlik egy kristály-létformába, amely azonban behatol az elméjükbe és Sheppard alakját felvéve álmaikban terrorizálni kezdi őket. Az expedíciónak meg kell állítania a lényt.

4x05 Travelers
Az egyik felderítésen Sheppard alezredest fogságba ejti egy magukat Utazóknak nevező faj, akik évszázodok óta csillaghajókon élve járják a galaxist Ős technológiák után kutatva, hogy később elpusztíthassák a lidérceket.

4x06 Tabula Rasa
Egy vírus Teyla és Ronon kivételével mindenkinél amnéziát okoz Atlantiszon, ezért az expedíciónak meg kell találnia a gyógymódot, ha nem akarják örökre elveszteni az emlékeiket.

4x07 Missing
Mikor Új Athoszra utaznak, Teylát és Dr. Kellert megtámadja egy agresszív, primitív emberi törzs, miközben az athosziak a jelek szerint eltűntek.

4x08 The Seer
Carter alezredesnek el kell határoznia, hogy hallgat-e egy olyan jövendölésre, amely szerint az expedíciónak szövetségre kell lépnie egy lidérc tudóssal a Replikátorok ellen. Teyla tovább nyomoz a népe után.

4x09 Miller`s Crossing
McKay húgát a Földön túszul ejti egy Henry Wallace nevű tudós, aki halálosan beteg lányát atlantiszi nanotechnológiával szeretné meggyógyítani. Sheppard és Ronon a Földre utaznak, hogy megmentsék a tudósokat.

4x10 This Mortal Coil

4x11 Be All My Sins Remember`d
Az expedíció felkeresi a hanyatló lidérc anyaflottát, hogy a segítségüket kérjék a replikátorok elleni közelgő háborúhoz, akik jelenlétükkel már a galaxis egész népességét fenyegetik.

4x12 Spoils of War

4x13 Quarantine
Egy Atlantiszon folytatott karanténteszt próbára teszi az expedíción belüli kapcsolatokat.

4x14 Outcast

4x15 Midway

4x16 Trio

4x17 Harmony
Sheppard alezredesnek és Dr. McKay-nek meg kell védenie egy idegen világ trónörökését, akire a beavatási szertartáson Genii katonák támadnak rá.

4x18 The Kindred I.

4x19 The Kindred II.

4x20 "Az évadzáró"

Fordította : MasCot